铷原子提供的是非常稳定的长期频率参考，但系统仍然需要一个性能优秀的本地振荡器来产生实际使用的频率信号。高性能铷原子钟中经常采用OCXO作为本地振荡器。控制系统通过检测OCXO与原子参考之间的频率误差，对本地振荡器进行校准。这样可以同时获得较好的短期稳定性、低相位噪声和优异的长期频率准确度。